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娜美偶然得到一张珍兽岛的地图，据说那里埋藏着无价的宝藏，草帽海贼团的诸位不顾乔巴的阻拦，决定向这座小岛挺进。正在此时，海底火山爆发，将黄金梅利号抛向空中。机缘巧合，他们竟然被抛到了珍兽岛。这个小岛由会说人话的动物统治，它们的老国王麒麟狮已经仙逝，偶然跌落于此的乔巴被众兽奉为新的国王。乔巴拗不过众兽，权且任职。正当珍兽岛为新国王的诞生欢欣鼓舞之时，贪婪邪恶的巴特拉伯爵及其爪牙登陆小岛。为了传说中的“国王宝藏”，他不惜对岛上的动物大开杀戒。他们也势必和草帽海贼团发生冲突……
本片根据日本漫画家尾田荣一郎的同名原著改编，是2002年上映的第三部动画剧场版。